Manajer Jurnal mengatur dan menyesuaikan sistem agar cocok dengan jurnal melalui serangkaian halaman manajemen. Proses itu dimulai dengan lima langkah Setup, tapi juga termasuk bagian-bagian yang diterbitkan, nada dan kata-kata di dalam email standar jurnal, bahasa yang tersedia untuk jurnal, statistik yang diterbitkan jurnal, dan alat-alat yang dibuat agar tersedia untuk para pembaca.